二仁溪，是一条台湾的河流，旧名为二层行溪，在1950年改名为二仁溪。地处台湾南部，是 高雄市 、 台南市 的界河，源于高雄市 内门乡 木栅里山猪湖（海拔460米），主流长度约63.20公里。
简介
二仁溪位于台湾省西南部，属于中央管河川，旧名为二层行溪，取自中下游 聚落 名。亦为高雄市、台南市的界河，源于高雄市内门区木栅里山猪湖（海拔460米），主流长度约63.20公里。二仁河段又有不同的名称，上游在岗山头以上称为分水溪，中游称为冈山溪，其中下游称为角带围溪，下游才称为二层行溪或二赞行溪。出海口原来向西南经刘 出海的主河道，在 爱新觉罗·旻宁 3年（1823年）7月因暴风雨，出海口转向改道西北由 高雄市 茄萣区 白砂仑北方入海。主要支流有三爷宫溪、深坑子溪、港尾沟溪、松子脚溪及牛稠埔溪； 流域面积 达350.04平方公里。荷据时期称为清水溪（de Verse Rivier）。
二仁溪发源地位于高雄市 内门乡 山猪湖，属于内门 丘陵 之山区，是 阿里山山脉 最南端在高雄市境内的馀脉，故二仁溪和 台南市 其他四条中央管河川，均属于阿里山山脉 水系 。二仁溪流域所包含的县、市之区域为2市及12区，同时也是现今南台湾台南市、高雄市二大 直辖市 之界河。流经区域包括 高雄市 的内门区、 田寮乡 、 阿莲乡 、 路竹区 、 湖内乡 、 茄萣区 ，以及台南市的龙崎区、关庙区、 归仁区 、 仁德区 、 南区 和 永康区 。
环境问题
二仁溪在早期十分清澈，因当时 制糖 繁荣 聚落 二层行而得名。日据时期兴建之车路 糖厂（现仁德糖厂）亦在其支流三爷宫溪畔。中游流域在1980年代，是专门处理废五金回收与提炼的工厂聚集地。这些工厂使用不少有毒的酸性化学药剂，且未做污水排放即将 废水 都倒入二仁溪中；在岸边也堆积不少电子废弃物（如 电路板 、电线），导致二仁溪河水污染相当严重，旧有“台湾的 黑龙江省 ”之称；加以其支流三爷宫溪流域中，有大量的养猪厂排放废水，其污染程度包括下游到上游，都呈现重度污染的黑色，溪水流动缓慢，是台湾三大污染河川的第一名，同时也是全世界重金属污染最严重的河川。下游的 喜米 和养鱼业依然因溪底沉积的重金属受到污染，陆续传出不少销毁、污染和居民传染病的新闻，包括出海口养殖 牡蛎科 变成绿色，出现“绿牡蛎污染”事件。
其污染程度的严重性，甚至由CNN专题报道。2001年，环保署强制拆除二仁溪旁的废五金溶炼厂，在 台南市 拆除16家以上的非法工厂，并协助合法业者转移厂区至 高雄市 路竹区 本洲工业区、台南科学工业区及彰滨工业区。因减少污染源，已减轻为中度污染，但仍有不肖业者偷排 废水 事件。另外，当台风季节一来，就连同三爷宫溪泛滥成灾，是政府着手整治的重点河川。
主要支流
二仁溪的主要支流包括三爷公溪、港尾沟、六甲溪、文贤溪、深坑子溪、龟洞溪、松子脚溪、牛稠埔溪、打廊溪、牛埔溪和 茄苳溪 。其中，台南市龙崎区境内是二仁溪中游右岸支流松子脚溪的中、上游流域，松子脚溪中游河段称为坪溪，上游河段成为苦苓脚溪，而二仁溪主流未流经龙崎区。 台南市 永康区 境内是二仁溪下游右岸支流三爷宫溪的上游流域，又名大湾中排、大排，三爷宫溪流经台南市永康区、东区、 仁德区 等三个人口密集的都会区区域，而永康区、仁德区更是工厂林立、工业区面积辽阔之工业重镇。二仁溪主流未流经永康区。
水系主要河川
二仁溪 三爷公溪港尾沟六甲溪 文贤溪 深坑子溪 龟洞溪 松子脚溪 牛稠埔溪 打廊溪 牛埔溪 茄 溪